019年3月19日 訊 /生物谷BIOON/ --在研究克羅恩?。ㄒ环N胃腸道炎癥性疾?。┑念I(lǐng)域，一個(gè)重要的問題是如何將其致病原因與該病癥中固有的全身性炎癥反應(yīng)分開。對(duì)此，醫(yī)學(xué)博士Subra Kugathasan領(lǐng)導(dǎo)的研究人員最近發(fā)表了一項(xiàng)分析，研究了炎癥跡象，以評(píng)估可能的原因。
Kugathasan實(shí)驗(yàn)室的研究生Hari Somineni與埃默里和喬治亞理工學(xué)院的遺傳學(xué)家合作，采用了一種復(fù)雜的方法進(jìn)行探究。結(jié)果發(fā)表在《Gastroenterology》雜志上。
該小組研究了患有克羅恩病的兒科患者血液樣本中的DNA甲基化情況，包括診斷和治療后及隨訪。這些信息來自164名患有克羅恩病的兒童和74名對(duì)照的血液樣本。
“我們的研究強(qiáng)調(diào)了進(jìn)行縱向剖析，觀察治療前后患者的重要性，而不是僅僅采取橫斷面，”Somineni說。
DNA甲基化是一個(gè)動(dòng)態(tài)過程，可以通過打開或關(guān)閉基因來影響復(fù)雜疾病的分子表型。研究人員觀察到，兒童克羅恩病患者在診斷時(shí)破壞的甲基化模式在治療炎癥后恢復(fù)到類似對(duì)照組。
Kugathasan是馬庫斯亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院和兒童保健學(xué)院的兒科和人類遺傳學(xué)教授，也是兒童移植和免疫介導(dǎo)疾病中心的主任。 Somineni是遺傳學(xué)和分子生物學(xué)系的研究生。
作者寫道，血液中絕大多數(shù)與疾病相關(guān)的甲基化變化“是炎癥的短暫后果，因而是疾病的結(jié)果”。 “我們所看到的是炎癥特征的治療可能從根本上治療克羅恩病的癥狀，而不是原因。”他們補(bǔ)充說：“這可能至少部分解釋了為什么克羅恩病通常仍然是終身緩解和復(fù)發(fā)疾病，盡管治療炎癥癥狀。”
由于樣本來自患者的血液，而不是他們的腸子。因此，白細(xì)胞中的基因主要提供有關(guān)全身性炎癥水平的信息是有道理的，這些信息在成功治療后會(huì)降低。 Somineni說，從腸道組織或位于腸道的免疫細(xì)胞中取樣可能會(huì)產(chǎn)生不同的結(jié)果。
研究人員采用“孟德爾隨機(jī)化”分析方法，以描繪可能導(dǎo)致疾病或由疾病引起的甲基化變化。這使他們能夠消除炎癥，揭示可能成為疾病發(fā)展的甲基化變化;這些甲基化變化似乎介導(dǎo)已知非編碼變體（單核苷酸多態(tài)性或SNP）的遺傳風(fēng)險(xiǎn)。將甲基化數(shù)據(jù)與現(xiàn)有遺傳信息整合已經(jīng)指出了編碼核糖體蛋白S6激酶A2的基因RPS6KA2 - 一個(gè)Somineni計(jì)劃進(jìn)一步研究的基因。
資訊出處：Sifting through signs of inflammation to analyze causes of Crohn's disease
原始出處：Hari K. Somineni et al. Blood-derived DNA Methylation Signatures of Crohn's Disease and Severity of Intestinal Inflammation, Gastroenterology (2019). DOI: 10.1053/j.gastro.2019.01.270
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